Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00303Q3SY05 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00303Q3SY05 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms