Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TTLL9Q3SXZ7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms