Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP41Q3LFD5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms