Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF4BQ2VIQ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF4BQ2VIQ3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms