Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCK2Q16822 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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