Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA9Q16790 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA9Q16790 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA9Q16790 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA9Q16790 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA9Q16790 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CA9Q16790 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CA9Q16790 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CA9Q16790 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CA9Q16790 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CA9Q16790 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CA9Q16790 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CA9Q16790 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CA9Q16790 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CA9Q16790 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CA9Q16790 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CA9Q16790 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CA9Q16790 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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CA9Q16790 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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CA9Q16790 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CA9Q16790 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CA9Q16790 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CA9Q16790 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CA9Q16790 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CA9Q16790 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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CA9Q16790 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CA9Q16790 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CA9Q16790 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CA9Q16790 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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