Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM1Q16610 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM1Q16610 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
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