Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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