Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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VAMP3Q15836 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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VAMP3Q15836 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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