Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTF1Q15361 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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