Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PCM1Q15154 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms