Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCOLCEQ15113 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCOLCEQ15113 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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