Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
POLD3Q15054 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLD3Q15054 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms