Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBFBQ13951 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms