Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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