Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4BQ13620 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4BQ13620 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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