Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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CUL1Q13616 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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CUL1Q13616 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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