Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRR1Q13601 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRR1Q13601 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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