Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1orf61Q13536 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms