Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCIRG1Q13488 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCIRG1Q13488 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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