Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMAD4Q13485 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAD4Q13485 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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