Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3B2Q13435 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SF3B2Q13435 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B2Q13435 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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