Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3BPQ13352 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms