Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP140Q13342 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP140Q13342 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP140Q13342 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SP140Q13342 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SP140Q13342 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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