Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RESTQ13127 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RESTQ13127 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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RESTQ13127 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RESTQ13127 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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RESTQ13127 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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RESTQ13127 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RESTQ13127 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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RESTQ13127 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RESTQ13127 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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