Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSTF3Q12996 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CSTF3Q12996 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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