Protein–RNA interactions for Protein: Q12235

YCT1, High affinity cysteine transporter, yeastyeast

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YCT1Q12235 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.08□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 NUP188YML103C 4968 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 NUP192YJL039C 5052 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YGR283CYGR283C 1026 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 RPL33BYOR234C 324 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YPR099CYPR099C 357 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 MUK1YPL070W 1839 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.07□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 PPN1YDR452W 2025 nt1.06□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 SLX4YLR135W 2247 nt1.06□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 PAU2YEL049W 363 nt1.06□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YLR255CYLR255C 354 nt1.06□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 CTK3YML112W 891 nt1.06□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YOR248WYOR248W 303 nt1.06□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YSY6YBR162W-A 198 nt1.06□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 SPR3YGR059W 1539 nt1.05□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YLL054CYLL054C 2532 nt1.05□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 SWI5YDR146C 2130 nt1.05□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YLL020CYLL020C 306 nt1.05□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.05□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.05□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 IRC16YPR038W 360 nt1.05□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 SHE9YDR393W 1371 nt1.05□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 PAN3YKL025C 2040 nt1.05□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 SGO1YOR073W 1773 nt1.04□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YDL016CYDL016C 303 nt1.04□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YKL044WYKL044W 321 nt1.04□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 BER1YLR412W 825 nt1.04□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 ZIP1YDR285W 2628 nt1.04□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 MSH3YCR092C 3057 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YDR509WYDR509W 348 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YJR141WYJR141W 1044 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 RPL9BYNL067W 576 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 GAL7YBR018C 1101 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YOP1YPR028W 543 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 YBR071WYBR071W 636 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 GDS1YOR355W 1569 nt1.03□□□□□ -2.24
YCT1Q12235 VPS54YDR027C 2670 nt1.02□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.02□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YKL123WYKL123W 381 nt1.02□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 UBX4YMR067C 1251 nt1.02□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YBR032WYBR032W 303 nt1.02□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 KIP1YBL063W 3336 nt1.01□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 OCA6YDR067C 675 nt1.01□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.01□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YPR039WYPR039W 336 nt1.01□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 VAM6YDL077C 3150 nt1.01□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 SEC3YER008C 4011 nt1.01□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 NST1YNL091W 3723 nt1.01□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 SWI4YER111C 3282 nt1□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 TOF2YKR010C 2316 nt1□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 APL1YJR005W 2103 nt1□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 BUD3YCL014W 4911 nt1□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 SRP14YDL092W 441 nt1□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YDR008CYDR008C 351 nt1□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YDR029WYDR029W 315 nt1□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 RTR1YER139C 681 nt1□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 SVS1YPL163C 783 nt1□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 SNU56YDR240C 1479 nt0.99□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YJR029WYJR029W 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 SPT21YMR179W 2277 nt0.98□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 RPL34BYIL052C 366 nt0.98□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 snR14snR14 160 nt0.98□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 YCS4YLR272C 3531 nt0.98□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 NUT1YGL151W 3399 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 PIG1YLR273C 1947 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 snR84snR84 550 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 TMA22YJR014W 597 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 SPT7YBR081C 3999 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 PIP2YOR363C 2991 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 MKT1YNL085W 2493 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 NOC3YLR002C 1992 nt0.97□□□□□ -2.25
YCT1Q12235 EAF1YDR359C 2949 nt0.96□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 ILM1YJR118C 612 nt0.96□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.96□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 SPO75YLL005C 2607 nt0.96□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 SPO23YBR250W 1572 nt0.96□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 CDC39YCR093W 6327 nt0.95□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 LYS14YDR034C 2373 nt0.95□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 YDR114CYDR114C 303 nt0.95□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 MET32YDR253C 576 nt0.95□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 HIT1YJR055W 495 nt0.95□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 STB6YKL072W 2301 nt0.95□□□□□ -2.26
YCT1Q12235 APL3YBL037W 3078 nt0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms