Protein–RNA interactions for Protein: Q08687

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, yeastyeast

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA16Q08687 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.13□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 RPA34YJL148W 702 nt2.13□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 YLR053CYLR053C 327 nt2.13□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 TMA10YLR327C 261 nt2.13□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 CGI121YML036W 546 nt2.13□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 RPL32YBL092W 393 nt2.13□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 IRC23YOR044W 474 nt2.13□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 DFG16YOR030W 1860 nt2.13□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 CDC60YPL160W 3273 nt2.13□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 YCR043CYCR043C 384 nt2.12□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 IST2YBR086C 2841 nt2.12□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 RTT101YJL047C 2529 nt2.12□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 TOR2YKL203C 7425 nt2.12□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 SIR4YDR227W 4077 nt2.11□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 FKS1YLR342W 5631 nt2.11□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 YDL062WYDL062W 426 nt2.1□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 YDR008CYDR008C 351 nt2.1□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 PHS1YJL097W 654 nt2.1□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.1□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 RPL40BYKR094C 387 nt2.1□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 HCH1YNL281W 462 nt2.1□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 YDR341CYDR341C 1824 nt2.1□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 GUP1YGL084C 1683 nt2.09□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 PEX8YGR077C 1770 nt2.09□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.09□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.09□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 CYB5YNL111C 363 nt2.09□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 HHT1YBR010W 411 nt2.09□□□□□ -2.07
TMA16Q08687 RPH1YER169W 2391 nt2.09□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 GYP5YPL249C 2685 nt2.09□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.08□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YIL059CYIL059C 366 nt2.08□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YJR011CYJR011C 786 nt2.08□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 PUT3YKL015W 2940 nt2.08□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 SYH1YPL105C 2550 nt2.07□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 RPL42BYHR141C 321 nt2.07□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YKL136WYKL136W 399 nt2.07□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 MRPL31YKL138C 396 nt2.07□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YNL114CYNL114C 372 nt2.07□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 RPL42AYNL162W 321 nt2.07□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 NAM7YMR080C 2916 nt2.06□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 RPL37BYDR500C 267 nt2.06□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 PRE4YFR050C 801 nt2.06□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 PET309YLR067C 2898 nt2.05□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 UBP1YDL122W 2430 nt2.05□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.05□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.05□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 TOR1YJR066W 7413 nt2.05□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 VPS34YLR240W 2628 nt2.04□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 PLC1YPL268W 2610 nt2.04□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.04□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YAF9YNL107W 681 nt2.04□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YSY6YBR162W-A 198 nt2.04□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 TFC8YPL007C 1767 nt2.03□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.03□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 TIM18YOR297C 579 nt2.03□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 YPL225WYPL225W 441 nt2.03□□□□□ -2.08
TMA16Q08687 FAB1YFR019W 6837 nt2.02□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 ARP7YPR034W 1434 nt2.02□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.02□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YKL118WYKL118W 312 nt2.02□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.02□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YNL146WYNL146W 303 nt2.02□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 RKM1YPL208W 1752 nt2.02□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 CAT2YML042W 2013 nt2.01□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YBP1YBR216C 2025 nt2.01□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 SSQ1YLR369W 1974 nt2.01□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 SWI6YLR182W 2412 nt2.01□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 EFR3YMR212C 2349 nt2.01□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 SGO1YOR073W 1773 nt2.01□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YDR102CYDR102C 333 nt2.01□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.01□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 PAC1YOR269W 1485 nt2.01□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 BUD2YKL092C 3315 nt2□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 HDA3YPR179C 1968 nt2□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 ABM1YJR108W 372 nt2□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 PXA2YKL188C 2562 nt2□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 HER1YOR227W 3741 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 RTP1YMR185W 2946 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 SWI5YDR146C 2130 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 FMP23YBR047W 528 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 TDA9YML081W 3756 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 PAU18YLL064C 363 nt1.98□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 PAU6YNR076W 363 nt1.98□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 NOP53YPL146C 1368 nt1.98□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 OSH6YKR003W 1347 nt1.97□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YGR265WYGR265W 411 nt1.97□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 YHL041WYHL041W 450 nt1.97□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 NUT2YPR168W 474 nt1.97□□□□□ -2.09
TMA16Q08687 USO1YDL058W 5373 nt1.96□□□□□ -2.1
TMA16Q08687 RPL38YLR325C 237 nt1.96□□□□□ -2.1
TMA16Q08687 YCL023CYCL023C 348 nt1.96□□□□□ -2.1
TMA16Q08687 RIM20YOR275C 1986 nt1.96□□□□□ -2.1
TMA16Q08687 CHC1YGL206C 4962 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA16Q08687 ATG9YDL149W 2994 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA16Q08687 YHL037CYHL037C 402 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA16Q08687 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA16Q08687 MCM22YJR135C 720 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA16Q08687 ZRG17YNR039C 1818 nt1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.5 ms