Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GOLGA3Q08378 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GOLGA3Q08378 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms