Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDR1Q08345 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms