Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms