Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP4Q07065 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP4Q07065 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP4Q07065 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.7 ms