Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 snR84snR84 550 nt1.05□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 CIC1YHR052W 1131 nt1.05□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 ABM1YJR108W 372 nt1.05□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 RCN2YOR220W 798 nt1.05□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 FMP23YBR047W 528 nt1.05□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 EST2YLR318W 2655 nt1.05□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 SHE9YDR393W 1371 nt1.05□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 SPO75YLL005C 2607 nt1.04□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 COF1YLL050C 432 nt1.04□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 PAU18YLL064C 363 nt1.04□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 DDR48YMR173W 1293 nt1.04□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 PAU6YNR076W 363 nt1.04□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 MSH5YDL154W 2706 nt1.04□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 MSN5YDR335W 3675 nt1.03□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 MET32YDR253C 576 nt1.03□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 ANS1YHR126C 480 nt1.03□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 NOP15YNL110C 663 nt1.03□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 DCP2YNL118C 2913 nt1.03□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 YDL152WYDL152W 366 nt1.02□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 KAP122YGL016W 3246 nt1.02□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 SPR3YGR059W 1539 nt1.02□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 RPS18BYML026C 441 nt1.02□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YNR025CYNR025C 360 nt1.02□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YPR039WYPR039W 336 nt1.02□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 NCA2YPR155C 1851 nt1.02□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 BUD3YCL014W 4911 nt1.02□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 MVP1YMR004W 1536 nt1.01□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 DGR2YKL121W 2559 nt1.01□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YGR265WYGR265W 411 nt1.01□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YNL114CYNL114C 372 nt1.01□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 HHT1YBR010W 411 nt1.01□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YPR099CYPR099C 357 nt1.01□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 MTC7YEL033W 420 nt1□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 NST1YNL091W 3723 nt1□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 MAK10YEL053C 2202 nt1□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 IML1YJR138W 4755 nt1□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 PAN3YKL025C 2040 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 HDA3YPR179C 1968 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 SRP14YDL092W 441 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 EMC4YGL231C 573 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YAP3YHL009C 993 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 APQ13YJL075C 417 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 VPS55YJR044C 423 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 GPI15YNL038W 690 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YBL073WYBL073W 312 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YOR248WYOR248W 303 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 IRR1YIL026C 3453 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 ZRG17YNR039C 1818 nt0.99□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 SWI5YDR146C 2130 nt0.98□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YDR509WYDR509W 348 nt0.98□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YBR032WYBR032W 303 nt0.98□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YOR376WYOR376W 369 nt0.98□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YGR130CYGR130C 2451 nt0.97□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 UFD2YDL190C 2886 nt0.97□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YDL158CYDL158C 309 nt0.97□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.97□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YER135CYER135C 393 nt0.97□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 RPL9AYGL147C 576 nt0.97□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 HUR1YGL168W 333 nt0.97□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 YGR025WYGR025W 303 nt0.97□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 EMC5YIL027C 426 nt0.97□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 RAD50YNL250W 3939 nt0.96□□□□□ -2.25
NEJ1Q06148 SEC5YDR166C 2916 nt0.96□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.96□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 TMA22YJR014W 597 nt0.96□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 RPL40BYKR094C 387 nt0.96□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YML003WYML003W 873 nt0.96□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 snR13snR13 124 nt0.96□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 NUP188YML103C 4968 nt0.96□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YJR029WYJR029W 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 SIP4YJL089W 2490 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 PAU2YEL049W 363 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YGL217CYGL217C 342 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 STE18YJR086W 333 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 TIM18YOR297C 579 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 TSC3YBR058C-A 243 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YOP1YPR028W 543 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YBR071WYBR071W 636 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 AZF1YOR113W 2745 nt0.95□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 TOF2YKR010C 2316 nt0.94□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.94□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 EAF6YJR082C 342 nt0.94□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 SLX4YLR135W 2247 nt0.94□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 GDS1YOR355W 1569 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YDL211CYDL211C 1119 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 YDR008CYDR008C 351 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
NEJ1Q06148 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
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