Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 SPC1YJR010C-A 285 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YLL020CYLL020C 306 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 CDC31YOR257W 486 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YCL007CYCL007C 393 nt0.83□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 VMA21YGR105W 234 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 AFB1YLR040C 675 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 GMC2YLR445W 567 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YPR099CYPR099C 357 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 SPR3YGR059W 1539 nt0.82□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 HNT1YDL125C 477 nt0.81□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YDR509WYDR509W 348 nt0.81□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YIL029CYIL029C 429 nt0.81□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 RPS18BYML026C 441 nt0.81□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YOP1YPR028W 543 nt0.81□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 IRC16YPR038W 360 nt0.81□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 GDS1YOR355W 1569 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 RTR1YER139C 681 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 PRM8YGL053W 714 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 NBP1YLR457C 960 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 CTK3YML112W 891 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 SLM6YBR266C 453 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 PPN1YDR452W 2025 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 PAN3YKL025C 2040 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 SWI5YDR146C 2130 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 PEX8YGR077C 1770 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 SGO1YOR073W 1773 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 MSH3YCR092C 3057 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 STB6YKL072W 2301 nt0.8□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 EAF1YDR359C 2949 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 SPO75YLL005C 2607 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 ROM2YLR371W 4071 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YFL012WYFL012W 447 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 MEI5YPL121C 669 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 SHE9YDR393W 1371 nt0.79□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 IFH1YLR223C 3258 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 snR84snR84 550 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YDR008CYDR008C 351 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YKL044WYKL044W 321 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 RPL9BYNL067W 576 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YNL319WYNL319W 441 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 YBR032WYBR032W 303 nt0.78□□□□□ -2.28
CUE4Q04201 VPS54YDR027C 2670 nt0.78□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 SWI4YER111C 3282 nt0.77□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 APL3YBL037W 3078 nt0.77□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YDL016CYDL016C 303 nt0.77□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YJR141WYJR141W 1044 nt0.77□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 MUK1YPL070W 1839 nt0.77□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.76□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YPR039WYPR039W 336 nt0.76□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 DCP2YNL118C 2913 nt0.76□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 NUT1YGL151W 3399 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 NUP192YJL039C 5052 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 SPT21YMR179W 2277 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YOR248WYOR248W 303 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 ZIP1YDR285W 2628 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 MKT1YNL085W 2493 nt0.75□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 KIP1YBL063W 3336 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YLL054CYLL054C 2532 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 PIG1YLR273C 1947 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 PIP2YOR363C 2991 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YDR133CYDR133C 336 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 BER1YLR412W 825 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 UBX4YMR067C 1251 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 NUT2YPR168W 474 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 SPO23YBR250W 1572 nt0.74□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YER135CYER135C 393 nt0.73□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 TMA22YJR014W 597 nt0.73□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 HIT1YJR055W 495 nt0.73□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YBR071WYBR071W 636 nt0.73□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 LYS14YDR034C 2373 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 TOF2YKR010C 2316 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 YEL057CYEL057C 702 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 HUR1YGL168W 333 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 RUF22RUF22 515 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 ERP4YOR016C 624 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 IRC23YOR044W 474 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 SNU56YDR240C 1479 nt0.72□□□□□ -2.29
CUE4Q04201 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 SIP4YJL089W 2490 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 NOC3YLR002C 1992 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 OCA6YDR067C 675 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 SDH2YLL041C 801 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 SVS1YPL163C 783 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.71□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 PXA2YKL188C 2562 nt0.7□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.7□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 RPL32YBL092W 393 nt0.7□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 BUD3YCL014W 4911 nt0.7□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YCS4YLR272C 3531 nt0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 81.4 ms