Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 STF2YGR008C 255 nt1.94□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 URM1YIL008W 300 nt1.94□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 NFU1YKL040C 771 nt1.94□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 HUG1YML058W-A 207 nt1.94□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 CCH1YGR217W 6120 nt1.94□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 DIE2YGR227W 1578 nt1.93□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 QCR7YDR529C 384 nt1.93□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YLR287CYLR287C 1068 nt1.93□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YOR146WYOR146W 306 nt1.93□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 SEF1YBL066C 3447 nt1.93□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 TBS1YBR150C 3285 nt1.93□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 TFC8YPL007C 1767 nt1.93□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 RTP1YMR185W 2946 nt1.92□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 MKT1YNL085W 2493 nt1.92□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YDL152WYDL152W 366 nt1.92□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.92□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 CGI121YML036W 546 nt1.92□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 DNF3YMR162C 4971 nt1.92□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 DFG16YOR030W 1860 nt1.92□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 ADR1YDR216W 3972 nt1.91□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YOL159CYOL159C 516 nt1.91□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 LEE1YPL054W 906 nt1.91□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YGR250CYGR250C 2346 nt1.91□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 LHS1YKL073W 2646 nt1.9□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 MYO2YOR326W 4725 nt1.9□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 NOP53YPL146C 1368 nt1.9□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 MEC1YBR136W 7107 nt1.9□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 SDH7YDR511W 402 nt1.9□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.9□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YBL073WYBL073W 312 nt1.9□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.9□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.9□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YNL144CYNL144C 2223 nt1.9□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 GNT1YOR320C 1476 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 AGC1YPR021C 2709 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 SWF1YDR126W 1011 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YDR269CYDR269C 324 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YBL071CYBL071C 309 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YPR099CYPR099C 357 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 CTR9YOL145C 3234 nt1.89□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 CBS1YDL069C 690 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YOR053WYOR053W 342 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YBR285WYBR285W 435 nt1.88□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 MDM20YOL076W 2391 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 PKH3YDR466W 2697 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YER079WYER079W 633 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 MSC6YOR354C 2079 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 IRE1YHR079C 3348 nt1.87□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 PAU3YCR104W 375 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 RPS24BYIL069C 408 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 ABM1YJR108W 372 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 FMP23YBR047W 528 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YPL185WYPL185W 396 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 FIG2YCR089W 4830 nt1.86□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 HIR3YJR140C 4947 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 PAN3YKL025C 2040 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 PFD1YJL179W 330 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 MRPL50YNR022C 420 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 YPL182CYPL182C 384 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 UBR2YLR024C 5619 nt1.85□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 TOF2YKR010C 2316 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 HMRA1YCR097W 381 nt1.84□□□□□ -2.11
SYF1Q04048 RLM1YPL089C 2031 nt1.84□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YGR265WYGR265W 411 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YHR138CYHR138C 345 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 RPL42BYHR141C 321 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 RPL42AYNL162W 321 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YPR012WYPR012W 255 nt1.83□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YGR130CYGR130C 2451 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 RTT102YGR275W 474 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YIL102CYIL102C 306 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 UBC7YMR022W 498 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YNL114CYNL114C 372 nt1.82□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YGL239CYGL239C 315 nt1.81□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.81□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YAR047CYAR047C 321 nt1.81□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 SAR1YPL218W 573 nt1.81□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 RPS27AYKL156W 249 nt1.8□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YLR334CYLR334C 381 nt1.8□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 BSC3YLR465C 309 nt1.8□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 LAA1YJL207C 6045 nt1.8□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.8□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 snR56snR56 88 nt1.79□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YDR008CYDR008C 351 nt1.79□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.79□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 TRX1YLR043C 312 nt1.79□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 RPL9BYNL067W 576 nt1.79□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 SKI3YPR189W 4299 nt1.79□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 HDA3YPR179C 1968 nt1.79□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 MAK10YEL053C 2202 nt1.79□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 MSH5YDL154W 2706 nt1.78□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YDL011CYDL011C 324 nt1.78□□□□□ -2.12
SYF1Q04048 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.78□□□□□ -2.12
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