Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POU3F1Q03052 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms