Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSG1Q02413 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG1Q02413 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms