Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTN2Q02246 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms