Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms