Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms