Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAP1Q01518 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAP1Q01518 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms