Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRCDQ00LT1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms