Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SORDQ00796 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SORDQ00796 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SORDQ00796 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORDQ00796 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORDQ00796 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORDQ00796 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms