Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG7P83436 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG7P83436 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG7P83436 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG7P83436 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG7P83436 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG7P83436 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms