Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNB1P62873 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNB1P62873 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNB1P62873 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
GNB1P62873 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNB1P62873 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNB1P62873 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNB1P62873 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNB1P62873 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms