Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLF3P57682 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF3P57682 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF3P57682 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF3P57682 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF3P57682 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLF3P57682 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms