Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNQ4P56696 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNQ4P56696 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms