Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX10P56693 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX10P56693 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX10P56693 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX10P56693 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX10P56693 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX10P56693 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX10P56693 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX10P56693 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX10P56693 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX10P56693 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX10P56693 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX10P56693 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms