Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP9P55211 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP9P55211 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms