Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEMP55040 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEMP55040 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEMP55040 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEMP55040 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEMP55040 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEMP55040 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GEMP55040 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GEMP55040 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GEMP55040 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GEMP55040 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GEMP55040 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEMP55040 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms